# 一键分析（生成结构差异报告）
python skills/transfer_old_latex_to_new/scripts/run.py analyze \
  --old /path/to/NSFC_2025 \
  --new /path/to/NSFC_2026

# 一键应用（执行迁移，apply前自动快照）
python skills/transfer_old_latex_to_new/scripts/run.py apply \
  --old /path/to/NSFC_2025 \
  --new /path/to/NSFC_2026 \
  --run-id <上一步输出的run_id>

# 一键编译（验证迁移结果）
python skills/transfer_old_latex_to_new/scripts/run.py compile \
  --run-id <run_id> \
  --new /path/to/NSFC_2026

# 一键恢复（回滚到apply前状态）
python skills/transfer_old_latex_to_new/scripts/run.py restore \
  --run-id <run_id> \
  --new /path/to/NSFC_2026

bash skills/transfer_old_latex_to_new/scripts/migrate.sh \
  --old /path/to/NSFC_2025 \
  --new /path/to/NSFC_2026

python skills/transfer_old_latex_to_new/scripts/run.py analyze \
  --old /path/to/NSFC_2025 \
  --new /path/to/NSFC_2026 \
  --runs-root /path/to/runs

runs/<run_id>/
├── input_snapshot/     # 旧新项目输入快照
├── analysis/           # 结构分析JSON（sections_map_*.json, structure_diff.json）
├── plan/               # 迁移计划（migration_plan.json）
├── backup/             # Apply前新项目快照（用于restore）
├── logs/               # 执行日志与编译输出
│   ├── apply_result.json        # 迁移执行结果
│   ├── compile_summary.json     # 编译摘要
│   ├── compile_*_*.out.txt      # 编译标准输出
│   ├── compile_*_*.err.txt      # 编译标准错误
│   └── latex_aux/               # LaTeX 中间文件隔离目录
│       ├── main.aux             # 辅助文件
│       ├── main.log             # 编译日志
│       ├── main.bbl             # BibTeX 输出
│       ├── main.blg             # BibTeX 日志
│       ├── main.out             # hyperref 输出
│       ├── main.toc             # 目录文件
│       └── *.aux                # 其他辅助文件
└── deliverables/       # 交付物（PDF、报告、指南）